A las wenas messi 
De toda esa lista que nombras solo tengo el Chrono Cross, tengo la version de USA (imagino que es la que tienes) y a mi me funciona perfectamente, supongo que estas usando la version 1.6.0 asi que te comentare como la tengo yo despues de muchas pruebas (la 1.7.0 todavia no he tenido tiempo de probarla) y de romperme la cabeza porque nadie daba una respuesta a los fallos y he tenido que aprender a base de muchas pruebas.
Hay que tener en cuenta lo siguiente, ES ABSOLUTAMENTE IMPRESCINDIBLE tener el wnaspi32.dll instalado en el directorio del emulador (o cualquier otro software que expresamente lo necesite como puede ser el Cube Media Player u otro emuladores (hay muchos que lo piden)), supongo que tienes windows xp, como es bien sabido este no tiene soporte aspi, hay dos alternativas, instalar unos drivers de Adaptec QUE NO FUNCIONAN en este caso o descargarte la libreria de Nero, da igual que tengas Nero instalado, por algun misterio del windows los programas no la encuentran, la solucion consiste en bajartela de ftp://ftp6.nero.com/wnaspi32.dll y la guardas en el mismo directorio en que tienes instalado el ePSXe.
El problema de que en algunos juegos no se oye el audio y si los efectos es porque seguramente tienen audio digital en lugar de str y el controlador de cd que trae el emulador por defecto va bastante mal, la solucion consiste en bajarte e instalar el SaPu's CD-ROM Plugin y configurarlo de la siguiente manera:
- Drive selection, creo que no necesita explicacion 
- Interface type y read mode en autodetect
- Caching level, la opcion nº 3
- Cache size, la maxima
- Track ISO9660 File System, activado
Con esto se deberia de oir perfectamente el audio de los juegos que tienen el sonido en CDDA pero hace falta algo mas, el modulo de sonido que tiene el emulador es un poco penoso, hay que instalar el Eternal SPU Plugin, y se configura asi.
- Segun lo seleccionas para configurar todas las opciones debes estar activadas incluida la de SPU IRQ hack ya que muchos juegos de Square lo utilizan y si no no se oyen, en los demas juegos no tiene ningun efecto asi que actvalo.
- Una vez metidos en la configuracion (boton configure obviamente) las opciones que son de activar se activan todas excepto Show realtime config windows por motivos obvios (veras que hay alguna para los juegos de Square).
- Audio device DirectSound con buffer size 64
- Audio out method SPUAsync en mode Smooth
- Fine tuno 0
- Reverb, yo tengo Neill's pero se puede poner otro si no te gusta.
Estos plugins te los puedes descargar desde http://www.ngemu.com/psx/epsxe.php?action=plugins, hay mas pero yo ni los probaria, funcionan bastante mal, los probe hace tiempo y tienen muchos bugs, de todos modos si utilizas la 1.7.0 se supone que estos no te hacen falta ya que corrige un monton de fallos y con los que tiene en el core es suficiente (ya te contare cuando la pruebe a fondo).
Esto en cuanto al audio, en cuanto al video se deben de utilizar los plugins de Pete ya que son los mejores y mas compatibles, si tienes una GForce 4 activa la opcion para tal efecto y activa la opcion Special Game Fixes y dentro de ella las que veas que te pueden afectar.
Bien, despues de toda esta parrafada deberia funcionarte todo bien igual que a mi, ya te digo, no me falla ni el primero y mira que he probado un monton.
Ya me contaras que tal te van estos consejos 